秦王并不满足六国疆域上的统一，他希望将六国的衣食住行等各方面都统一，这样也方便管理。

秦王统一六国之后，豪气万丈，他觉得自己德兼三皇，功过五帝，王的称号已经显示不了他非凡的成就，于是在三皇五帝中各取一个字，称皇帝，而他又称始皇帝，他的后代便称二世、三世、一直到万世皇帝。

之后，他又规定了自己不再自称为“我”、“寡人”之类，而改称“朕”。在皇帝之下，他又设了三公九卿的中央官职，又设博士顾问，设前后左右将军掌征伐，他认为，有这样强大的行政机构和军事机构，秦王朝能够传至千秋万代。

秦始皇还崇信战国时期阴阳家邹衍的五德之说，他认为秦为水德，所以规定了十月为年首，崇尚黑色。这点在现在的一些影视剧中可以看到，秦军都是一律黑甲，杀气十足。不仅如此，秦始皇还规定了各种成数都是以六为约数，像发冠都是六寸，车宽都是六尺，车驾都是六匹马等。

为了不重蹈历史的覆辙，秦始皇采纳了李斯的意见，废除分封制，实行郡县制度，最早将天下封为三十六郡，其后增至四十一郡，还在首都咸阳与各郡之间修筑标准的驰道，加强中央对地方的控制。

秦始皇又主持制定了一系列的法律条文，讲究“依法治国”，不讲人情。他还推广商鞅重农抑商的思想，崇尚农业，抑制商业。为了显示自己一统天下，不会再有战争，秦始皇又下令没收民间所有的兵器，铸成了巨型编钟宫悬。

秦始皇陵兵马俑

秦始皇迄今做的一切都还只是开始，除了用国家机器控制人民之外，秦始皇认为思想控制也非常重要。根据李斯的建议，公元前213年，秦始皇下诏将《秦记》以外的诸侯史书，以及不是公家收藏的《诗》、《书》、百家语全部烧毁，并禁止人们私下谈论《诗》、《书》。就这样，之前积累的大量宝贵的历史书籍都被秦始皇毁于一旦。当然，秦始皇也不是笨人，对于医药、占卜、农业方面的工具书，他没有不分青红皂白地烧毁。

当然，秦始皇焚书并不是像一些人宣传的那样是因为本性暴虐，其中发生的一件事才是焚书的导火索。

秦始皇喜欢出巡，并且身后总跟着一队声势浩大的随从队，其中博士也在内。这些博士跟在其中是做什么呢?原来秦始皇每到一个地方都喜欢建一个石碑，在石碑上刻上夸赞自己统一六国的功绩，这博士随行便是为了帮秦始皇撰写碑文。博士之位都是由儒家学者担当，编撰这种歌功颂德的碑文正是他们的拿手活，其中著名的泰山顶上的颂德碑就是儒家学派的博士和旧鲁国儒生的杰作，把秦始皇哄得眉开眼笑。

就因为秦始皇这次高兴，儒家学派便认为时机已经成熟了，可以进一步用儒家思想去劝诫秦始皇的一些行为，让儒家学派能够发扬光大。于是便建议秦始皇将自己的儿子封到各地去做国王。

公元前213年，儒生淳于越正式上书道：“从前商周两个王朝，立国都近千年，能统治这么久的原因就在于分封兄弟子侄。现在陛下虽然拥有整个世界，但是你的儿子却跟平民一样，一旦有什么危险，就没有人相救了。凡事要是不效仿古人，而能长久存在，这是从来没有听说过的。”

就这一番儒家思想浓重的话，让秦始皇做出了焚书坑儒的过激行为。当时秦始皇公布淳于越这份奏疏，宰相李斯立刻反驳道：“五帝的制度不足效仿，夏商周三代的制度不足为训。现在时代变了，当然应该采用新制度。陛下建立的是万世功勋，这是前无古人的事业。淳于越说的这些陈年旧事，早就已经过时了。儒家学者见到新鲜事物先是议论，然后再坚持说现在的制度没有古人好，分明是扰乱民心。”

秦始皇听后，觉得李斯说得非常有道理，这些儒生实在可恶，便决定焚烧儒书。其后发生的方士事件，又惹得秦始皇对儒生大开杀戒。

当时有两位道家方士侯生和卢生，这两人实际上是江湖骗子，扬言为秦始皇找长生不老药，结果一无所获，怕秦始皇怪罪，便悄悄出逃，逃走之前还跟人说：“嬴政这个人残暴不仁，只信任他手下的官吏，博士虽然有七十多人，不过都是混吃混喝，根本得不到重视。他喜欢杀人，拒绝听自己的过失。方士们一旦法术不能应验，就会被处死。他只知道求长生不老药，没有人会那么傻，把长生不老药给他。”

这段话传到了秦始皇耳中，龙颜大怒，咆哮道：“我找了这么多知识分子一同治理国家，目的就是为了永久的和平。你们之中有人说炼丹可以长生不老，像徐福这些人，花费了我这么多金钱，什么都没有找到。而你们还私下攻击我、诽谤我，侯生、卢生，我平日待他们并不薄，想不到如今竟然这样诽谤我！”

大怒之下的秦始皇下令将咸阳所有的高级儒生全部逮捕，并派人调查他们平日里有没有什么对秦始皇不利的言论。经过调查，证据确凿有罪的有四百六十人，其中虽说都是一些方士，其实大部分都还是儒家之士，秦始皇下令将这些人全部坑杀。

因为这些事，儒家学派恨透了秦始皇，在此之后两千多年的时间里，儒家思想占据了主导地位之后，对秦始皇的报复从未间断，甚至不断地升级，发泄对秦始皇焚书坑儒的不满。